به گزارش آتیه آنلاین، ملک زاده در نامه استعفای خود به شیوه های مدیریتی دکتر نمکی در وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، اعتراض و انتقاداتی  نسبت به عملکرد وزیر بهداشت، مطرح کرده است. وی همچنین از آنچه بی‌توجهی به پژوهش و تحقیقات خواند، انتقاد و تأکید کرد که فعالیتهای علمی و پژوهشی محققان علوم پزشکی در طول هفت سال گذشته نادیده گرفته شده است؛ فعالیت هایی که (ایران با آن) در سخت ترین شرایط تحریم و امکانات بودجه ای، به بالاترین سطح تولیدات کمی و رشد کیفی و استناد به مقالات نسبت به گذشته رسیده و رتبه نخست منطقه و کشورهای اسلامی را داراست. 

 ملک زاده همچنین پیش از انتشار نامه استعفا، در یادداشتی انتقادات خود را به وزیر بهداشت رسانه ای کرده بود. هنوز خبری درباره تأیید استعفای ملک زاده منتشر نشده و وزیر بهداشت به اظهارات وی واکنشی نداشته است.

همچنین خبر می‌رسد که علی نوبخت، نایب‌رییس و دبیر شورای مشورتی بیماری کرونا، نیز در نامه‌ای‌ به وزیر بهداشت از کارش کناره گرفته و نوشته: «سخنان شما در اصفهان در کوبیدن علم و دانشمندان پزشکی جان بر کف ایران و پاسخ معاونت پژوهشی، راهی برای هم‌کاری بنده با جناب‌عالی و  وزارت‌خانه نگذاشته.»

وزیر بهداشت در اصفهان به بخش تحقیقات وزارت‌خانه خودش حمله کرده‌بوده: «درباره کرونا  یک مدل به بنده بدهید که پیش‌بینی‌ها درست بوده باشد! تحقیقات کاربردی در حوزه سلامت در کشور نداریم و اما تا زمانی که تحقیقات کشور، مقاله محور باشد، تحقیقات راهگشای مشکلات کشور نخواهد بود.»