«طرح مقابله با نفوذ سرویس‌های اطلاعاتی و دولت‌ها یا نهادهای بیگانه» که کلیات آن در مجلس به تصویب رسیده، سازمان‌های مردم‌نهاد و تشکل‌های مدنی را نیز در دامنه شمول خود قرار داده و محدودیت‌هایی از مرحله ثبت فعالیت‌ها و دریافت مجوز تا همکاری‌های آموزشی، پژوهشی و مالی با طرف‌های خارجی را دربرمی‌گیرد.
طرح مقابله با نفوذ بیگانگان با پیش‌بینی مجازات‌های سنگین برای ارتباطات رسانه‌ای، علمی، فرهنگی و اقتصادی با نهادهای خارجی، با انتقادهایی درباره محدود شدن آزادی بیان و افزایش نگاه امنیتی مواجه شده است.
